Daniel Münich působí v akademickém think tanku IDEA při CERGE-EI (Centrum pro ekonomický výzkum a doktorské studium – Univerzita Karlova a Akademie věd ČR) kde učí a dělá empirický výzkum orientovaný na veřejné politiky. Specializuje se na problematiku ekonomiky školství a vzdělávání a trhu práce, hodnocení dopadů veřejných politik a výsledků výzkumu.